为探究不同填料的挂膜特性，分别构建4组填料生物滤池（珊瑚石、悬浮球填料、弹性填料、组合填料），比较其自然挂膜成熟时间，并利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析其细菌群落结构。结果表明，珊瑚石、悬浮球填料、弹性填料、组合填料的挂膜成熟时间分别为15 d、18 d、21 d、21 d。不同生物滤池中填料生物膜上的细菌丰度和多样性均高于对应的生物滤池水体，悬浮球填料生物滤池的多样性指数最高。在门分类水平上，不同生物滤池的优势菌群主要以变形菌门（Proteobacteria）为主。在属分类水平上，不同生物滤池的脱氮功能菌有所不同，亚硝酸菌属（Nitrosomonas）、硝化刺菌属（Nitrospina）在弹性填料生物滤池中的相对丰度大于其他生物滤池；芽孢杆菌属（Bacillus）是珊瑚石生物滤池的优势菌属；亚硫酸杆菌属（Sulfitobacter）、栖海杆菌属（Maribacter）、Phaeodactylibacter是悬浮球填料生物滤池特有的具有反硝化作用的优势菌属。总体上，不同填料生物滤池均有较完整的硝化−反硝化脱氮微生物体系，这些微生物在海水养殖尾水脱氮处理中具有重要作用。