《海洋环境科学》被以下国内外重要检索数据库收录：

北大核心——《中文核心期刊要目总览》

中国科技论文统计源期刊——《中国科技期刊引证报告》（CJCR）

中国科学引文数据库——CSCD

美国信息集团ProQuest数据库 2001年至今来源期刊

英国《动物学记录》（ZR,Zoological Record）1998年至今来源期刊

日本《科学技术振兴机构数据库（中国）》(JSTChina) 2007年至今来源期刊

俄罗斯《文摘杂志》(AJ，VINITI)2000年至今来源期刊

美国《化学文摘（网络版）》（SciFinder Scholar Web）1999—2015年来源期刊

美国《乌利希期刊指南（网络版）》(Ulrichsweb) 注册期刊